Шкоди організму від агар–агару можливий тільки внаслідок його надмірного вживання. Рекомендована норма продукту на добу – 4 м Кількість понад заявленого може привести до розладу кишечника, дисбалансу власної мікрофлори і виникнення інфекційних захворювань.